Yksittäisistä osakilpailuista ei jaeta maailmancupin osakilpailupisteitä, vaan kokonaiskilpailun lopputulosten mukaan annetaan kullekin sijoittuneelle hänen sijalukuunsa maailmancupin yksittäisessä tavallisessa maailmancupin osakilpailussa oikeuttamat pisteet nelinkertaisina. Palkintorahoja kauden 2006–2007 kilpailussa jaettiin 750 000 Sveitsin frangia (n. 468 000 euroa). Alkuperäinen palkintopotti oli miljoona Sveitsin frangia mutta Nove Meston kilpailuiden peruuntumisten myötä kokonaispalkintopottia pudotettiin 25 prosenttia.
Kokonaiskilpailun voittaa osakilpailuihin vähiten aikaa käyttänyt hiihtäjä. Kilpailuissa jaetaan hyvityssekunteja, jotka hyvitetään Tour de Skin kokonaisajasta. Sprinttikilpailuissa hyvityssekunteja jaetaan 30 parhaalle; voittajalle 50 sekuntia, toiselle 40 sekuntia, kolmannelle 30 sekuntia, neljännelle 28 sekuntia, viidennelle 26 sekuntia ja siitä eteenpäin sekunnin välein niin, että sijalle 30 yltäneen ajasta vähennetään yksi sekunti. Sprinttikilpailun hyvityssekunnit hyvitetään karsintakilpailun ajasta, kun kilpailun loppujärjestys määräytyy välierien ja A- ja B-finaalien perusteella.
Yhteislähtökilpailuissa hyvityssekunteja jaetaan välikirien ja kyseisen kilpailun kolmelle parhaalle: voittajalle 15 sekuntia, toiselle 10 sekuntia ja kolmannelle 5 sekuntia. Väliaikalähtökilpailuiden ajat lasketaan sellaisenaan kokonaisaikaan eikä hyvityssekunteja jaeta.
Kokonaiskilpailun lisäksi Tour de Skillä käydään kirikilpailu, jonka voittaa eniten hyvityssekunteja saanut kilpailija. Kirikilpailuun lasketaan hyvityssekunnit sprinttikilpailuista (München ja Asiago) sekä Oberstdorfin ja Val di Fiemmen yhteislähtökilpailuista.
